مروری بر متاژنومیکس، کاربردهایش و پیشرفت های اخیر در این زمینه

سال انتشار: 1396
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,106

فایل این مقاله در 7 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRONOMY01_178

تاریخ نمایه سازی: 29 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

مطالعه میکروارگانیسم هایی که در قسمت های مختلف این سیاره وجود دارند چالش های بسیاری، از قبیل کشف انواع ناشناخته این موجودات و نحوه و نوع ارتباط آنها با محیط اطراف خود، طی زمان داشته است. متاژنومیکس به معنی مطالعه ژنوم های جمعی اعضای یک جامعه میکروبی می باشد. این روش شامل شبیه سازی و تجزیه و تحلیل ژنوم بدون کشت موجودات در جامعه می باشد. در نتیجه این فرصت را به وجود می آورد تا گوناگونی ساکنان میکروبی این سیاره شرح داده شوند که بسیاری از آنها هنوز قابل کشت نمی باشند. این شاخه جدید علم رویکردی را برای مطالعه جوامع میکروبی بعنوان یک واحد کل، بدون کشت منحصر به فرد اعضاء ارائه می کند. متاژنومیکس مستلزم استخراج DNA از جامعه می باشد به طوری که تمام ژنوم های موجودات جامعه با هم مخلوط می شوند تا "کتابخانه متاژنومیکس" را ایجاد کند. دو شاخه اصلی در این حیطه شامل متاژنومیکس عملکردی و متاژنومیکس مبتنی بر توالی یابی با پتانسیل هایشان مورد بحث قرار خواهند گرفت. در این مقاله سعی شده است به نحوه شکل گیری و پیشرفتهای اخیر در این حوزه اشاره گردد. انتقال از میکروبیولوژی کلاسیک به مطالعات مدرن متاژنومیکس نیاز به توسعه و تخصصی شدن شاخه های جدیدی از دانش از جمله روشهای مختلف کامپیوتری را دارا می باشد که برخی از آنها اشاره خواهد شد.

کلیدواژه ها:

متاژنومیکس عملکردی ، متاژنومیکس مبتنی بر توالی یابی ، میکروارگانیسم ، میکروبیولوژی

نویسندگان

عبدالکریم زارعی

استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جهرم.

سارا فلاح

دانش آموخته گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جهرم