بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری
محل انتشار: فصلنامه پژوهش های علوم دامی، دوره: 29، شماره: 4
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 197
فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ANIMAL-29-4_002
تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1400
چکیده مقاله:
زمینه مطالعاتی: آنالیز ژنتیکی جمعیتهای وحشی برای حفظ تنوع زیستی و افزایش دانش در مورد بقای این گونهها و یافتن عوامل تهدید کننده و یا کمک کننده در حفظ این جمعیت مهم و ضروری میباشد. هدف: لذا مطالعه حاضر برای شناسایی توده ژنتیکی موجود، بررسی چگونگی روابط، شکلگیری و تنوع ژنتیکی مارالهای ایرانی با بهرهگیری از اطلاعات توالی ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی انجام شد. روش کار: جهت انجام پژوهش حاضر نمونههای خون، مو یا بافت ۷۸ راس مارال اخذ و DNA آنها استخراج گردید. ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی با استفاده آغازگرهای اختصاصی با روش PCR تکثیر شده و تمامی محصولات PCR توالییابی گردید. سپس توالیهای مورد نظر با استفاده از نرم افزارهای BioEdit جهت بررسی تنوع نوکلئوتیدی همتراز شد، با استفاده از نرم افزار Mega ، درخت فیلوژنتیکی رسم گردید. توالیهای مارال با استفاده از نرم افزار DnaSp آنالیزشد. نتایج: نتایج حاصل منجر به شناسایی جهشهایی گردید که به ایجاد ۵ هاپلوتیپ برای ناحیه D-Loop منتهی شد و تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و متوسط تفاوت نوکلئوتیدی برای ناحیه D-Loop به ترتیب ۲۱۸/۰ ، ۰۰۰۷/۰ و ۴۹۱/۰ بهدست آمد. شاخصهای تنوع ژنتیکی نشان داد که شش جمعیت مورد بررسی مارال احتمالا تجربه باتل نک را پشت سر گذاشته است. نتیجهگیری: در پرتو نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل جمعیتها از این هاپلوتیپها ، میتوان نتیجهگیری کرد که نوسانات اخیر در اندازه جمعیت و وقفه در جریان ژن به دلیل انتقال گوزنهای قرمز یک جمعیت به سایر زیستگاهها در گذشته باشد.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
لیلا آقازاده
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
سعید نیک بین
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
فرزاد میرزایی آقجه قشلاق
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
نعمت هدایت ایوریق
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
مراجع و منابع این مقاله:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :