بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 197

فایل این مقاله در 17 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ANIMAL-29-4_002

تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

زمینه مطالعاتی: آنالیز ژنتیکی جمعیت­های وحشی برای حفظ تنوع زیستی و افزایش دانش در مورد بقای این گونه­ها و یافتن عوامل تهدید کننده و یا کمک کننده در حفظ این جمعیت مهم و ضروری می­باشد. هدف: لذا مطالعه حاضر برای شناسایی توده ژنتیکی موجود، بررسی چگونگی روابط، شکل­گیری و تنوع ژنتیکی مارال­های ایرانی با بهره­گیری از اطلاعات توالی ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی انجام شد. روش کار: جهت انجام پژوهش حاضر نمونه­های خون، مو یا بافت ۷۸ راس مارال اخذ و DNA آنها استخراج گردید. ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی با استفاده آغازگرهای اختصاصی با روش PCR تکثیر شده و تمامی محصولات PCR توالی­یابی گردید. سپس توالی­های مورد نظر با استفاده از نرم افزارهای BioEdit جهت بررسی تنوع نوکلئوتیدی هم­تراز شد، با استفاده از نرم افزار Mega ، درخت فیلوژنتیکی رسم گردید. توالی­های مارال با استفاده از نرم افزار DnaSp آنالیزشد. نتایج: نتایج حاصل منجر به شناسایی جهش­هایی گردید که به ایجاد ۵ هاپلوتیپ برای ناحیه D-Loop منتهی شد و تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و متوسط تفاوت نوکلئوتیدی برای ناحیه D-Loop به ترتیب  ۲۱۸/۰ ، ۰۰۰۷/۰ و ۴۹۱/۰ به­دست آمد. شاخص­های تنوع ژنتیکی نشان داد که شش جمعیت مورد بررسی مارال احتمالا تجربه باتل نک را پشت سر گذاشته است. نتیجه­گیری: در پرتو نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل جمعیت­ها از این هاپلوتیپ­ها ، می­توان نتیجه­گیری کرد که نوسانات اخیر در اندازه جمعیت و وقفه در جریان ژن به دلیل انتقال گوزن­های قرمز یک جمعیت به سایر زیستگاه­ها در گذشته باشد.

نویسندگان

لیلا آقازاده

گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی

سعید نیک بین

گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی

فرزاد میرزایی آقجه قشلاق

گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی

نعمت هدایت ایوریق

گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Alijani S, ۲۰۰۹. Tracking major genes in farm animals using ...
  • Alinaghizadeh H, Mohammad Abadi MR, Zakizadeh S, ۲۰۱۰. Exon ۲ ...
  • Amills M, Capote J, Tomas A, Kelly L and Obexer-Ruff ...
  • Anderson SAT, Bankier G, Barrell M, De Bruijn A, Couson ...
  • Azor PJ, Monteagudo LV, Luque M, Tejedor MT and Rodero ...
  • Bailes SM, Devers JJ, Kirby JD and Rhoads DD, ۲۰۰۷. ...
  • Boom R, Sol CJA, Salimans MMM, Jasen CL, WertheimVan Dillen ...
  • Boore JL, ۱۹۹۹. Animal mitochondrial genomes. Nucleic Acids Research ۲۷:۱۷۶۷-۱۷۸۰ ...
  • Borowski Z, wisøocka M, Matosiuk P, Mirski K, Krysiuk M, ...
  • Cavalli –Sforza, LL, Feldman, MW, ۲۰۰۳. The application of molecular ...
  • Bruford M, Bradley D and Luikart G, ۲۰۰۳. DNA markers ...
  • Colgan S, Obrian L, Maher M, Shilton N, McDonnell K ...
  • Colombo F, Marchisio E, Pizzini A and Cantoni C, ۲۰۰۲. ...
  • Conrad AM and Davis SK, ۲۰۰۱. Molecular Hnshghts into the ...
  • Ettore Randi NM, Françoise CH, Amélie B and Emmanuel JP, ...
  • Epperson BK, ۲۰۰۳. Geographical Genetics. Princeton: Princeton University Press ...
  • Frank KN, Bleier B, Toth L, Suger P, Horn E, ...
  • Geist V, ۱۹۹۱. Bones of contention revisited: did antlers enlarge ...
  • Geist V, ۱۹۹۹. Deer of the World. Their Evolution, Behaviour ...
  • Ghovvati S, Nassiri MR, Mirhoseini SZ, Moussavi AH and Javadmanesh ...
  • Groves T, Katis P, Madden Z, Manickam K, Ramsdem D, ...
  • Haghi H, Malekian M, Montazami S, Khordazadeh P, Goshtasib Miogony ...
  • Hiendleder S, Lewalski H, Wassmuth R and Janke A, ۱۹۹۸. ...
  • Hiendleder S, Mainz K, Plante Y and Lewalski H, ۱۹۹۸. ...
  • Hiendleder S, Kaupe B and Janke A, ۲۰۰۸. Complete mitochondrial ...
  • Hmwe SS, Zachos FE, Eckert I, Lorenzini R, Fico R, ...
  • Javanroh Ali Abad A, ۲۰۰۲. Genetic Diversity Evaluation of Six ...
  • Jazin E, Soodyall H, Jalonen P, Lindholm E, Stoneking M ...
  • Kiabi BH, Zehzad B, Darreh Shouri BF, Majnoonian H and ...
  • Kiabi BH, Salmann Mahini A, Rezaie HR and Mir Karimi ...
  • Kim KH and Lee JH, ۲۰۰۲. Phylojenic relationships of Asian ...
  • Kitano T, Umetsu KS, Lockley AK and Osawa M, ۲۰۰۷. ...
  • Lorenzini R, Garofalo L, ۲۰۱۵. Insights into the evolutionary history ...
  • Ludt CJ, Schroeder W, Rottmann O, Kuehn R, ۲۰۰۴. Mitochondrial ...
  • Lundrigan T, Reist JD, Ferguson M, ۲۰۰۵. Microsatellite genetic ariation ...
  • Manjunath B, Paramod K and Rout K, ۲۰۰۳. Phelogeography and ...
  • Mannen H, Kohno M, Nagata Y, Tsuji S and Bradley ...
  • Nabata K, Kaji K, Nagata J, Masuda R, ۲۰۰۷. Genetic ...
  • Naderi S, Rezaei HR, Taberlet P, Zundel S, Rafat SA, ...
  • Natonek-Wisnievska MN, Slota E and Kalisz B, ۲۰۱۰. Use of ...
  • Rousset F, ۲۰۰۴. Genetic Structure and Selection in Subdivided Populations. ...
  • Saccone E, ۱۹۹۱, Commento a Zen: saggio sul testo di ...
  • Tajima F, ۱۹۸۳. Evolutionary relationship of DNA sequences in finite ...
  • Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S, ۲۰۰۷. Molecular ...
  • Teletchea F, Maudet C and Hanni C, ۲۰۰۵. Food and ...
  • Trense W, ۱۹۸۹. The Big Game of the World. Paul ...
  • Viard F, Justy F, Jarne P, ۱۹۹۷. Population dynamics inferred ...
  • Whitehead GK, ۱۹۷۲. The Deer of the World. Constable, London. ...
  • Xin C, Chen H, Lei C, Wang S, Xue K ...
  • Yuasa T, Nagata J, Hamasaki S, Tsuruga H, Furubayashi K, ...
  • Zamani V, Rezaei HR, Baziyan S, Aghili SM, Shabani A, ...
  • Zhao Q, Xu H, Li D, ۲۰۱۷. Complete mitochondrial genome ...
  • نمایش کامل مراجع