استراتژی های تعیین ژنوتیپ انتخابی گاوهای ماده در برنامه های انتخاب ژنومی با شبیه سازی جمعیت گاو شیری

سال انتشار: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 250

فایل این مقاله در 16 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ANIMAL-28-2_009

تاریخ نمایه سازی: 26 اردیبهشت 1400

چکیده مقاله:

زمینه مطالعاتی: افزودن اطلاعات ژنوتیپی و فنوتیپی گاوهای ماده به جمعیت مرجع، راهبردی سودمند در افزایش میزان صحت و کاهش اریب برآورد ارزش اصلاحی ژنومی ارزیابی شده است. هدف: مطالعه حاضر تاثیر بکارگیری داده­های ژنومی گاوهای ماده در جمعیت مرجع توسط استراتژی­های متفاوت انتخاب، تعداد افراد ژنوتیپ شده و وراثت­پذیری بر صحت و اریبی ارزش اصلاحی ژنومی را در جمعیت تایید مورد بررسی قرار داد. روش کار: پس از ایجاد جمعیت اولیه، جمعیت­های ثانویه و اصلی به­صورت روش چهار مسیری مشابه به­نژادی گاو شیری شبیه­سازی شد. سپس تعداد متفاوتی از گاو ماده (۲۵۰۰، ۵۰۰۰ و ۱۰۰۰۰ ماده) جهت افزودن به جمعیت مرجع حاوی ۵۰۰۰ گاو نر برتر تعیین ژنوتیپ گردید. دو سطح وراثت­پذیری متوسط (۳/۰) و پایین (۰۵/۰) به­طور مستقل در این مطالعه درنظر گرفته شد. نتایج: انتخاب گاوهای ماده جهت ژنوتیپ کردن با درنظر گرفتن صحت برآورد ارزش اصلاحی (AH و ATT)، ضمن صحت بالاتر، میانگین مربعات خطا و اریب کمتری را نسبت به انتخاب بدون درنظر گرفتن صحت (H و TT) نشان دادند. انتخاب گاوهای ماده با روش ATT، به­طورکلی برای دو صفت منجر به بیشترین افزایش صحت برآورد ارزیابی ژنومی در محدوده ۱۲۳/۰ تا ۲۱۵/۰ شد. به دنبال آن روش­های R و TT به ترتیب بیشترین افزایش صحت ارزیابی ژنومی را داشتند. بدین­صورت افزایش صحت در محدوده ۱۱۷/۰ تا ۲۰۴/۰ در روش R و ۱۱۳/۰ تا ۱۹۶/۰ در روش TT مشاهده شد. تعیین ژنوتیپ گاوهای ماده با حداکثر ارزش اصلاحی (AH و H) منجر به کمترین صحت و بیشترین خطا و اریب گردید. با افزایش تعداد گاوهای ماده ژنوتیپ شده، MSE و اریب کمتر شد. متوسط ضریب رگرسیون TBV بر روی DGV در همه روش­های مورد مطالعه از ۱۲/۱ با ۲۵۰۰ گاو ماده به ۰۸/۱ با ۱۰۰۰۰ ماده برای صفت با وراثت­پذیری متوسط رسید. نتیجه­گیری نهایی: در میان روش­های مورد بررسی در این مطالعه افراد موجود در دو دامنه توزیع ارزش اصلاحی با حداکثر صحت کاندیداهای خوبی از افراد جامعه جهت تعیین ژنوتیپ و قرارگیری در جمعیت مرجع به­نظر می­رسند و اطلاعات بهتری را برای پیش­بینی افراد نسل بعد با هر نوع سطح ژنتیکی فراهم می­کنند.

کلیدواژه ها:

ارزیابی ژنومی ، تعیین ژنوتیپ انتخابی گاو ماده ، جمعیت تایید ، جمعیت مرجع

نویسندگان

النا دهنوی

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان

سعید انصاری مهیاری

گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان

فلاویو شنکل

مرکز بهبود ژنتیکی دام (CGIL)، دانشگاه گوئلف، انتاریو، کانادا

مهدی سرگلزایی

Semex Alliance, Guelph, ON, Canada

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Ansari-Mahyari S, Sørensen AC, Lund MS, Thomsen H and Berg ...
  • Bohmanova J, Sargolzaei M and Schenkel F, ۲۰۱۰. Characteristics of ...
  • Boligon AA, Long N, Albuquerque LG, Weigel KA, Gianola D ...
  • Bulmer MG, ۱۹۷۱. The Effect of Selection on Genetic Variability. ...
  • Cameron ND, ۱۹۹۷. Selection indices and prediction of genetic merit ...
  • Calus MP, Bouwman AC, Hickey JM, Veerkamp RF and Mulder ...
  • Darvasi A and Soller M, ۱۹۹۲. Selective genotyping for determination ...
  • Dehnavi E, Mahyari SA, Schenkel FS and Sargolzaei M, ۲۰۱۸. ...
  • Ehsani A, Janss L and Christensen OF, ۲۰۱۰. Effects of ...
  • Goddard ME and Hayes BJ, ۲۰۰۸. Review Article: Genomic selection. ...
  • Hayes BJ, Bowman PJ, Chamberlain AJ and Goddard ME, ۲۰۰۹. ...
  • Hill WG and Robertson A, ۱۹۶۸. Linkage disequilibrium in finite ...
  • Jenko J, Wiggans GR, Cooper TA, Eaglen SAE, Luff WGdeL, ...
  • Jensen-Seaman MI, Furey TS, Payseur BA, Lu Y, Roskin KM, ...
  • Jiménez-Montero JA, Gonzalez-Recio O and Alenda R, ۲۰۱۲. Genotyping strategies ...
  • Kinghorn BP, ۱۹۹۷. An Index of Information Content for Genotype ...
  • Kuhner MK, Beerli P, Yamato J and Felsenstein J, ۲۰۰۰. ...
  • Lander E and Botstein D, ۱۹۸۹. Mapping Mendelian factors underlying ...
  • Lourenco DA, Misztal I, Tsuruta S, Aguilar I, Ezra E, ...
  • Macrossan PE, ۲۰۰۴. Strategies to Minimize DNA Testing Costs for ...
  • Mc Hugh N, Meuwissen TH, Cromie AR and Sonesson AK, ...
  • Meuwissen T, Hayes B and Goddard ME, ۲۰۰۱. Prediction of ...
  • Nielsen R, ۲۰۰۴. Population genetic analysis of ascertained SNP data. ...
  • Pryce JE and Daetwyler H, ۲۰۱۲. Designing dairy cattle breeding ...
  • Pryce JE, Hayes BJ and Goddard ME, ۲۰۱۲ a. Genotyping ...
  • Pryce JE, Hayes BJ and Goddard ME, ۲۰۱۲ b. Novel ...
  • Sargolzaei M, ۲۰۱۴. SNP۱۱۰۱ User’s Guide. Version ۱.۰ ...
  • Sargolzaei M. and FS Schenkel, ۲۰۰۹. QMSim: a large-scale genome ...
  • Schefers JM and Weigel KA, ۲۰۱۲. Genomic selection in dairy ...
  • Thomasen JR, Willam A, Egger-Danner C and Sørensen AC, ۲۰۱۶. ...
  • Thomasen, JR, Sørensen AC, Lund MS and Guldbrandtsen B, ۲۰۱۴. ...
  • VanRaden PM, Olson KM, Null DJ and Hutchison JL, ۲۰۱۱. ...
  • VanRaden PM, Van Tassell C, Wiggans G, Sonstegard T, Schnabel ...
  • Wiggans GR, Cooper TA, VanRaden PM and Silva MV, ۲۰۱۰. ...
  • Wiggans GR, Vanraden PM and Cooper TA, ۲۰۱۲. Technical note: ...
  • نمایش کامل مراجع