طراحی پایگاه اطلاعاتی مولکولی محلی برای تسهیل شناسایی زیستگاههای گونه های پستانداران شاخص در ایران

شناسایی و حفاظت از زیستگاهها در راستای حفاظت از حیات وحش امری ضروری است. شناسایی زیستگاههای برخی از گونه ها نظیر برخی پستانداران که تراکم جمعیت کمی در طبیعت دارند، نیازمند به کارگیری تکنیکی کاربردی در این زمینه است. انجام مطالعات مولکولی روی نمایه های زیستی بر جای مانده از پستانداران در طبیعت و توالی یابی ژنوم، فرآیند شناسایی زیستگاهها و همین طور پایش جمعیت آنها را تسهیل کرده است؛ بنابراین طراحی و راه اندازی پایگاه اطلاعاتی مولکولی محلی در راستای شناسایی توالی های به دست آمده از نمایه های پستانداران و درنهایت، تسهیل شناسایی زیستگاههای آنها هدف اصلی این پژوهش است؛ بدین منظور گونه هایی از پستانداران ایران که براساس قوانین ملی یا برپایه IUCN در طبقات حفاظتی قرار داشتند و همچنین گونه های پستاندار پی سنگ برای مطالعه انتخاب شدند. نمونه برداری به روش غیر تهاجمی از گونه های مختلف پستاندار از سراسر ایران انجام گرفت. دو ناحیه ژنی D-loop و COXI توالی یابی شدند؛ سپس توالی های گونه های منتخب، متعلق به ژن های میتوکندریایی D-loop، COXI و Cyt b نیز از NCBI اخذ و پایگاه اطلاعاتی مولکولی محلی با استفاده از نرم افزار BLAST تهیه و راه اندازی شد. عملکرد پایگاه اطلاعاتی مولکولی محلی طراحی شده با استفاده از یک توالی Query سنجیده شد و پایگاه، توالی Query را به طور صحیح بازشناخت. این پایگاه شناسایی زیستگاه پستانداران مطالعه شده را با استفاده از شناسایی توالی های متعلق به نمایه های زیستی باقی مانده از آنها در زیستگاهها مقدور می سازد و به رفع چالش های موجود درزمینه شناسایی زیستگاهها برای برنامه ریزی های حفاظتی کمک شایانی خواهد کرد.

کلیدواژه ها:

شناسایی گونه ها ، پستانداران ، پایگاه اطلاعاتی مولکولی محلی ، ژن میتوکندریایی ، ایران