پاسخهای زودهنگام ترانسکریپتوم نخود زراعی به تنش سرما
- سال انتشار: 1399
- محل انتشار: فصلنامه علوم گیاهان زراعی ایران، دوره: 51، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_IJFCS-51-3_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 394
نویسندگان
دانشجوی دکتری گروه زراعت و اصلاح نباتات پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
استادیار موسسه تحقیقات کشاورزی دیم کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مراغه
دانشگاه RMIT ، ملبورن استرالیا
چکیده
در این مطالعه، پاسخهای ترانسکریپتوم دو ژنوتیپ نخود متحمل (Sel۹۶th۱۱۴۳۹) و حساس ILC۵۳۳)) به تنش سرمای کوتاه مدت (چهار درجه سانتیگراد پس از ۲۴ ساعت)، به کمک روش RNA-seq بررسی شد. تحت تنش سرما، محتوی پراکسید هیدروژن، پراکسیداسیون چربیهای غشا و نشت الکترولیتی غشا در گیاهان حساس در مقایسه با گیاهان متحمل، بهطور معنیداری افزایش یافت. در ژنوتیپ متحمل در مقایسه با گیاهان شاهد (بدون تنش سرما)، ۵۲۶ ژن، تغییر بیان معنیدار نشان دادند، بهطوری که ۲۶۱ و ۲۶۵ ژن، بهترتیب افزایش و کاهش بیان معنیدار داشتند. در ژنوتیپ حساس در مقایسه با گیاهان شاهد (بدون تنش سرما)، ۹۰۱ ژن تغییر بیان معنیدار نشان دادند که ۲۹۵ و ۶۰۶ ژن، بهترتیب افزایش و کاهش بیان معنیدار داشتند. نتایج نشان داد که ژنهای دارای بیان کاهشی، فراوانی بیشتری در مقایسه با ژنهای دارای بیان افزایشی در هر دو ژنوتیپ داشتند. همچنین تعداد ژنهای دارای بیان کاهشی ژنوتیپ حساس، ۳/۲ برابر در مقایسه با ژنوتیپ متحمل بود. بیان ۲۱۶ ژن در ژنوتیپ متحمل افزایش یافت در حالی که این ژنها در ژنوتیپ حساس کاهش بیان داشتند که تقریبا ۱۵ درصد آنها، ژنهای فاکتور رونویسی بودند. بر اساس الگوهای رونوشت شناسایی شده، بیان ژنهای مسیر سنتز برخی متابولیتها در ژنوتیپ متحمل، افزایش و در ژنوتیپ حساس، کاهش یافت. تحت تنش سرما، ۳۱ ژن در ژنوتیپ حساس افزایش و در ژنوتیپ متحمل کاهش بیان نشان دادند که ژنهای مولد هیستونها، تقریبا ۱۰ درصد این ژنها بودند. نتایج این مطالعه بیانگر نقش تعیین کننده پاسخهای زودهنگام، بهخصوص فاکتورهای رونویسی و تغییرات اپی ژنتیکی در تحمل به تنش سرما در نخود بود.کلیدواژه ها
بیان ژن, توالییابی, پاسخ سرما, نخود زراعی, RNAseqاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.