بازسازی شبکه‌های ژنی دخیل در پاسخ به تنش خشکی درگیاه جو
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: مجله تازه های بیوتکنولوژی سلولی – مولکولی، دوره: 8، شماره: 29
- کد COI اختصاصی: JR_NCMBJ-8-29_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 492
نویسندگان
Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
Department of Plant Breeding, Science and Research Branch, Islamic Azad University Tehran, Iran
Department of Molecular physiology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
چکیده
سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی میباشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژنهای کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است. مواد و روشها: تمامی ژنهای دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرم‌افزار Genevestigator شناسایی شدند. ترسیم شبکه برهم‌کنش پروتئینی و شناسایی ژنهای کلیدی با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape و بررسی هستی شناسی ژنها بوسیله نرم افزار AgriGO صورت گرفت. یافته ها: نتایج بدست آمده از بازسازی شبکه برهم‌کنش پروتئینی منجر به شناسایی 14 و 15 ژن کلیدی دخیل در تنش خشکی به ترتیب در مرحله نموی رویشی و زایشی شد. بحث: براساس نتایج بدست آمده، از موثرترین ژنهای کلیدی دخیل در تحمل به تنش خشکی میتوان به ژنهای عوامل رونویسی ARF1، ABF3، DREB1A، DREB2A،HY5 و HYHاشاره کرد. نتیجه گیری: بررسی هستی شناسی ژنهای پاسخدهنده به خشکی و هاب روشن ساخت که تنظیم فرایندهای زیستی، فرایندهای متابولیسمی، کنترل دوره نوری و فتوسنتز و همچنین تنظیم زمان گلدهی از مهمترین فرآیندهای تاثیر گذار بر این تنش میباشند.کلیدواژه ها
Barley, Drought stress, Biological network, Hub genes, گیاه جو, تنش خشکی, شبکه‌های زیستی, ژن هاباطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.