تشخیص مقاومت به افلوکساسین با روش مولکولی سریع Allele Specific PCR در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: فصلنامه زیست شناسی میکروارگانیسمها، دوره: 3، شماره: 9
- کد COI اختصاصی: JR_BJM-3-9_004
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 396
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران
استادیار میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد قم، گروه میکروبیولوژی، قم، ایران
دانشجوی دکتری تخصصی ژنتیک مولکولی، دانشگاه تربیت مدرس و مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، علوم پزشکی اراک،ایران
دانشجوی دکتری تخصصی پزشکی مولکولی، مرکز تحقیقات پزشکی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
استادیار مرکز تحقیقات سل و ریه، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، ایران
استادیار باکتری شناسی پزشکی، مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
چکیده
مقدمه : مقاومت به فلوروکینولونها در بیماری سل رو به گسترش است. تشخیص مقاومت به روش کشت خلط دو ماه به طول میانجامد. مطالعه حاضر، به منظور طراحی روشی برای تشخیص سریع مقاومت سویه ها ی کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به افلوکساسین انجام شد. مواد و روشها: در این مطالعه، DNA های استخراج شده از 41 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حساس و مقاوم به افلوکساسین موجود در بانک DNA مرکز تحقیقات سل و بیماریهای عفونی با دو روش مولکولیآلل اسپسیفیک پی سی آر ( AS-PCR ) و تعیین ترادف (سکوئنس)، برای تعیین موتاسیون در منطقه مرتبط با مقاومت ژن gyrA با هم مقایسه شدند. پرایمرهای داخلی برای تشخیص موتاسیونهای مرتبط با مقاومت طراحی و شرایط PCR تعیین شد. قطعه مورد نظر درتعدادی از نمونهها تعیین ترادف شده و بهعنوان استاندارد طلایی با روشهای ارائه شده مقایسه شد. نتایج: روش AS-PCR به خوبی قادر به تشخیص موتاسیون با تشکیل یا عدم تشکیل باند داخلی شد که نشان دهنده طراحی صحیح پرایمرها بود. روش AS-PCR اجرا و با توجه به نتایج بسیار خوب به عنوان روش عادی استفاده شد. در مجموع، از 41 سویه کلونیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس مطالعه شده، 37 سویه از نظر فنوتیپی (به روش کشت proportion ) مقاوم به افلوکساسین و 4 سویه حساس به این دارو بودند. از 37 سویه مقاوم از نظر فنوتیپی، 32سویه با روش AS-PCR مقاوم به افلوکساسین و 5 نمونه حساس تعیین شدند. نتایج تعیین ترادف، با نتایج روشهای استفاده شده انطباق داشت. حساسیت و ویژگی روش به ترتیب معادل 11/86 درصد و 100 درصد به دست آمد. بحث و نتیجهگیری: نتایج مطالعه حاضر نشان میدهد که روش AS-PCR طراحی شده میتواند به عنوان یک روش ساده و سریع برای تعیین حساسیت و مقاومت به افلوکساسین در سویههای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس استفاده شود. این روش تا کنون در منابع علمی گزارش نشده است.کلیدواژه ها
افلوکساسین, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, Allele Specific –PCRاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.