طراحی و بررسی مقایسه ای روشهای مولکولی تشخیص سریع مقاومت به داروهای تزریقی ضد سل در سویههای کلینیکی میکوباکتریوم توبرکلوزیس
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: فصلنامه زیست شناسی میکروارگانیسمها، دوره: 1، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_BJM-1-3_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 244
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم تحقیقات کردستان، ایران
استادیار میکروب شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم تحقیقات کردستان، ایران
دانشجوی دکتری تخصصی ژنتیک مولکولی، مرکز تحقیقات سل و عفونی کودکان، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
استادیار باکتری شناسی پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
دانشجوی کارشناسی ارشد میکروبیولوژی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم تحقیقات کردستان، ایران
دانشجوی دکتری تخصصی پزشکی مولکولی، مرکز تحقیقات پزشکی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی اراک، ایران
چکیده
مقدمه: در این تحقیق، برای تشخیص سریع مقاومت به کانامایسین، آمیکاسین، کاپرئومایسین، چند روش مولکولی طراحی و مقایسه شدند. مواد و روشها: از میان 120 سویه کلینیکی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، 70 سویه برای بررسی موتاسیونهای احتمالی انتخاب شدند. در روشPCR-RFLP از آنزیم ajii برای تشخیص سویه وحشی و از آنزیمBstFNI برای شناسایی سویه موتانت استفاده شد. علاوه بر این، در طراحی روش آلل اسپسیفیک همزمان (mAs PCR) از سه پرایمر اختصاصی برای تعیین حالتهای وحشی و نیز موتان کدونهای 1401 و 1402 استفاده شد. تعدادی از سویهها تعیین توالی (سکوئنس) شدند. نتایج: در روشPCR-RFLP از میان 70 سویه مورد بررسی، با آنزیم BstFNI، 17 سویه موتان از میان 24 سویه مقاوم فنوتیپی و 44 سویه غیر موتان از 46 سویه، حساس تشخیص داده شدند. حساسیت این روش 83/70 و ویژگی آن 65/95 درصد بود. آنزیم ajii از میان 52 سویه مورد بررسی، 12سویه موتان از میان 20 سویه مقاوم و29 سویه غیر موتان را از میان 32 سویه حساس فنوتیپی تشخیص داد. حساسیت این روش 60 و ویژگی آن 62/90 درصد بوده است. در روش آلل اسپسیفیک 23 سویه بررسی شدند. این روش قادر به تشخیص 3سویه موتان ازمیان6 سویه مقاوم و12 سویه غیرموتان ازمیان 17 سویه حساس فنوتیپی شد. حساسیت این روش50 و ویژگی آن 58/70 درصد بوده است. نتایج تعیین ترادفاثبات کننده صحت نتایج روشهای مولکولی استفاده شده، بود. بحث و نتیجهگیری: روشPCR-RFLP با آنزیم BstFNI، به عنوان یک روش سریع در تشخیص مقاومت مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به داروهای تزریقی خط دوم درمان سل پیشنهاد میشود.کلیدواژه ها
کانامایسین, آمیکاسین, کاپرئومایسین, مایکوباکتریوم توبرکلوزیس, مقاومت دارویی, تشخیص, PCR-RFLP, MAS-PCR اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.