مقایسه روش های مختلف اعتبارسنجی برای بررسی صحت انتخاب ژنومی به کمک داده شبیه سازی

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 223

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AHCONF05_015

تاریخ نمایه سازی: 26 آذر 1399

چکیده مقاله:

از زمان معرفی انتخاب ژنومی برای بررسی صحت انتخاب، روش های مختلف اعتبارسنجی ژنومی برای مقایسه صحت انتخاباستفاده شده است. در مطالعه حاضر از نرم افزار QMSim برای ایجاد یک جمعیت شبیه سازی شده استفاده شد. صحت انتخابژنومی در این پژوهش به کمک سه راهبرد محاسبه اثرات نشانگر (راهبرد اول: همبستگی بين ارزش اصلاحی پيش بينی و ارزش اصلاحی واقعی، راهبرد دوم: همبستگی بين ارزش اصلاحی ژنومی کل داده ها با داده مرجع و راهبرد سوم: همبستگی بين (G)EBV(t) و فنوتيپ تصحيح شده تقسيم بر ريشه دوم وراثت پذيری) برای دو روش تک مرحله ای و سنتی برآورد شد. به طور کلی نتیجه پژوهش حاضر نشان داد که استفاده از روش تک مرحله ای ژنومی نسبتبه روش سنتی صحت پیش بینی ژنومی را در تمام راهبردها افزایش داد. همچنین استفاده از همبستگی بین ارزش اصلاحی ژنومیکل داده ها با داده های مرجع در تمام راهبردها افزِايش دقت را نسبت به دو راهبرد ديگر به همراه داشت.

کلیدواژه ها:

اعتبارسنجی ژنومی ، داده شبیه سازی ، روش تک مرحله ای ، صحت پیش بینی ژنومی

نویسندگان

یحیی محمدی

استادیار و عضو هیات علمی دانشگاه ایلام- ایلام دانشگاه ایلام دانشکده کشاورزی عضو هیات علمی گروه علوم دامی