پروتئین اتصالی CTCF و تنظیمات اپیژنتیکی ژنوم

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: انگلیسی
مشاهده: 353

فایل این مقاله در 24 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-5-3_009

تاریخ نمایه سازی: 15 آذر 1399

چکیده مقاله:

پروتئین CTCF یک پروتئین متصل شونده به مولکول DNA است، که توالی آن کاملا حفاظت شده می­باشد و در  تنظیمات بیان ژنی، جدا کننده­های کروماتین، نقشه­گذاری ژنومی، غیر فعال سازی کروموزوم X، ساختارهای سطح بالاتر کروماتینی و پردازش متفاوت mRNA نقش ایفا می­کند. این خصوصیات چند کاره­ای CTCF، موجب پیشنهاد نقش حیاتی آن در رشد و نمو و بیماری­ها شده است. پروتئین CTCF تنها پروتئین شناخته شده­ای در مهره­داران است که در عملکرد جدا کننده­ها دخیل می­باشد. مطالعات اخیر نشان دادند که، CTCF می­تواند به عنوان یک عامل وراثتی در تنظیمات اپیژنتیکی باشد، که ارتباطات بین متیلاسیون DNA، ساختارهای سطح بالاتر کروماتینی و بیان ژن طی فرایند نمو را تنظیم می­کند. هدف این مطالعه مروری بر نقش CTCF در این منظرهای مهم تنظیم ژنومی می­باشد. تمام یافته­ها نشان می­دهند که CTCF می­تواند به عنوان یک استاد بافنده ژنوم پستانداران در نظر گرفته شود. 

کلیدواژه ها:

CTCF ، اپیژنتیک ، غیر فعال سازی کروموزوم X ، جداکننده‌ها ، سرطان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  •  Amiri-Roudbar M (2012). Quantification of CTCF transcript during maturation of ...
  • Apostolou E, Thanos D (2008). Virus infection induces NF-κB-dependent interchromosomal ...
  • Ariel M, Robinson E, McCarrey JR, Cedar H (1995). Gamete-specific ...
  • Arthold S, Kurowski A, Wutz A (2011). Mechanistic insights into ...
  • Bacher CP, Guggiari M, Brors B, Augui S, Clerc P, ...
  • Barski A, Cuddapah S, Cui K, Roh TY, Schones DE, ...
  • Bell AC, Felsenfeld G (2000). Methylation of a CTCF-dependent boundary ...
  • Bell AC, West AG, Felsenfeld G (1999). The protein CTCF ...
  • Bernstein BE, Meissner A, Lander ES (2007). The mammalian epigenome. ...
  • Botta M, Haider S, Leung IXY, Lio P, Mozziconacci J ...
  • Burcin M, Arnold R, Lutz M, Kaiser B, Runge D, ...
  • Chao W, Huynh KD, Spencer RJ, Davidow LS, Lee JT ...
  • Chen X, Xu H, Yuan P, Fang F, Huss M, ...
  • Chow J, Heard E (2009). X inactivation and the complexities ...
  • Chung JH, Whiteley M, Felsenfeld G (1993). A 5' element ...
  • Cuddapah S, Jothi R, Schones DE, Roh T-Y, Cui K, ...
  • Docquier F, Farrar D, D'Arcy V, Chernukhin I, Robinson AF, ...
  • Donohoe ME, Zhang LF, Xu N, Shi Y, Lee JT ...
  • Essien K, Vigneau S, Apreleva S, Singh L, Bartolomei M, ...
  • Fedoriw AM, Stein P, Svoboda P, Schultz RM, Bartolomei MS ...
  • Filippova GN, Fagerlie S, Klenova EM, Myers C, Dehner Y, ...
  • Filippova GN, Qi C-F, Ulmer JE, Moore JM, Ward MD, ...
  • Fiorentino FP, Giordano A (2012). The tumor suppressor role of ...
  • Fraser P, Bickmore W (2007). Nuclear organization of the genome ...
  • Gaszner M, Felsenfeld G (2006). Insulators: exploiting transcriptional and epigenetic ...
  • Handoko L, Xu H, Li G, Ngan CY, Chew E, ...
  • Herold M, Bartkuhn M, Renkawitz R (2012). CTCF: insights into ...
  • Jothi R, Cuddapah S, Barski A, Cui K, Zhao K ...
  • Kim TH, Abdullaev ZK, Smith AD, Ching KA, Loukinov DI, ...
  • Kornblihtt AR (2012). CTCF: from insulators to alternative splicing regulation. ...
  • Lobanenkov VV, Nicolas RH, Adler VV, Paterson H, Klenova EM, ...
  • Mohammadabadi MR, Amiri Roudbar M, Amiri Z, Momen M, Montazeri ...
  • Moore JM, Rabaia NA, Smith LE, Fagerlie S, Gurley K, ...
  • Morgan HD, Santos F, Green K, Dean W, Reik W ...
  • Ohlsson R, Lobanenkov V, Klenova E (2010). Does CTCF mediate ...
  • Ohlsson R, Renkawitz R, Lobanenkov V (2001). CTCF is a ...
  • Pan Q, Shai O, Lee LJ, Frey BJ, Blencowe BJ ...
  • Pant V, Mariano P, Kanduri C, Mattsson A, Lobanenkov V, ...
  • Payer B, Lee JT (2008). X chromosome dosage compensation: how ...
  • Phillips JE, Corces VG (2009). CTCF: master weaver of the ...
  • Pugacheva EM, Tiwari VK, Abdullaev Z, Vostrov AA, Flanagan PT, ...
  • Recillas-Targa F, Pikaart MJ, Burgess-Beusse B, Bell AC, Litt MD, ...
  • Shukla S, Kavak E, Gregory M, Imashimizu M, Shutinoski B, ...
  • Spilianakis CG, Lalioti MD, Town T, Lee GR, Flavell RA ...
  • Tazi J, Bakkour N, Stamm S (2009). Alternative splicing and ...
  • Torrano V, Chernukhin I, Docquier F, D'Arcy V, León J, ...
  • Vostrov AA, Quitschke WW (1997). The zinc finger protein CTCF ...
  • Wan L-B, Pan H, Hannenhalli S, Cheng Y, Ma J, ...
  • Wrenzycki C, Herrmann D, Lucas-Hahn A, Korsawe K, Lemme E, ...
  • Xu N, Donohoe ME, Silva SS, Lee JT (2007). Evidence ...
  • Zahmatkesh A, Amiri Roudbar M, Joupari MD (2013) A comparative ...
  • نمایش کامل مراجع