جداسازی و شناسایی تیپ های مختلف کلستریدیوم پرفرنجنس در منطقه جنوب کشور
- سال انتشار: 1394
- محل انتشار: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- کد COI اختصاصی: R-1090857
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 382
نویسندگان
چکیده
هر ساله تعداد زیادی دام و طیور و حتی انسان ها در اثر بیماری های باکتریایی ناشی از آلودگی به جنس کلستریدیا تلف می شوند و خسارات جانی و مالی فراوانی به بار می آورند. کلستریدیوم پرفرنجنس یکی از بیشترین گونه های بیماریزا در جنس کلستریدیوم است که توکسین های زیادی تولید می کند. این باکتری به تیپ های مختلف(A تا E) بر اساس توکسین های اصلی مترشحه تقسیم می شود. هدف از انجام این تحقیق شناسایی ژنوتیپ های مختلف کلستریدیوم پرفرنجنس در جنوب کشور می باشد. بر همین اساس از جمعیت های دامی در جنوب کشور نمونه گیری انجام شد. پس از کشت در محیط های مغذی و در شرایط بی هوازی، با استفاده از محیط های کشت افتراقی، باکتری های جنس کلستریدیا شناسایی گردید. در این تحقیق از 5/41% دامها کلستریدیوم جدا شد. استخراج DNA بر روی تمام گونه های کلستریدیوم جدا شده انجام شد. واکنش PCR با پرایمرهای اختصاصی انجام گردید. از 3026 نمونه از سه گروه دامی اخذ شده، 151 نمونه از گوسفندان، 68 نمونه از بزها و 135 نمونه از گاوها، کلستریدیوم پرفرنجنس جدا شد. تیپ های جدا شده کلستریدیوم پرفرنجنس شامل72% تیپ A، 4/5% تیپ B، 7/10% تیپ C، و 9/11% تیپ D بود. تیپ غالب در هر سه گروه تیپA بود و تیپB نسبت به سه تیپ دیگر شیوع کمتری داشت. با بررسی دندروگرام ها و بر اساس قرابت اسید های نوکلییک و درصد قرابت ژن های القا کننده توکسین های کلستریدیوم پرفرنجنس جدا شده، و سویه استاندارد و نیز ژن های ثبت شده در بانک ژن مشخص شد که اولا" قطعات تکثیر یافته در واکنش PCR، مربوط به کلستریدیوم پرفرنجنس است و ثانیا" با ژنوم القا کننده توکسین های سویه استاندارد مشابهت دارد. علاوه بر این با جداسازی و مشخص شدن تیپ های باکتری، این سویه ها ممکن است جهت استفاده در پروژه های تحقیقاتی و تولیدی موسسه مورد استفاده قرار گیرد.کلمات کلیدی: کلستریدیوم پرفرنجنس، توکسین، تشخیص، درخت فیلوژنی، PCRکلیدواژه ها
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.