مطالعه سیستماتیک مولکولی کنه های دامی (خانواده ایکسودیده) بر اساس آنالیز ITS2 و مقایسه ترادف کامل این توالی بین جنس و گونه های خانواده ایکسودیده
- سال انتشار: 1389
- محل انتشار: سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- کد COI اختصاصی: R-1059819
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 207
نویسندگان
چکیده
کنه های سخت(Acari ، Ixodidae ) انگلهای خارجی و خونخوار اجباری انسان و حیوانات هستند. مطالعات زیادی در مورد طبقه بندی کنه های خانواده ایکسودیده در ایران انجام شده است. در تشخیص هویت کنه های سخت مشکلاتی وجود دارد. مطالعه و استفاده از ابزارهای مولکولی در طبقه بندی کنه ها مانند سایر جانوران انجام شده است. یکی از این دستاوردها عبارت ازتکثیر بخشی از ژنوم DNA ریبوزومی به نام ITS2 است که می توان در شناسایی و تعیین هویت کنه ها از آن استفاده نمود. هدف از این مطالعه استفاده از تعیین توالی و استفاده از اختلافات این توالی ژنوم کنه ها و تعیین فیلوژنی مولکولی کنه ها می باشد. کنه ها در طی فصل مساعد رشد کنه ها جمع آوری شدند(در سال2007). آنها تشخیص داده شدند و DNA آنها استخراج شد. بعد از ازدیاد (تکثیر) این بخش در واکنش PCR برای تعداد 52 فرد باند اختصاصی ITS2 بدست آمد. از این تعداد 30 باندکه دارای کیفیت مناسب روی ژل الکتروفورز بودند خالص سازی شدند و برای تعیین توالی ارسال شدند. توالی های بدست آمده همسو سازی شدند (align ) شدند و برای بانک جهانی ژن (PubMed ) ارسال شدند. سطوح مختلف واریاسیون های درون گونه ای و بین گونه ای با استفاده از برنامه های مختلف تعیین شدند. سطح تنوع درون گونه ای توالی های بدست آمده برای هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم بالا بود ولی برای درماسنتور مارژیناتوس و رپی سفالوس تورانیکوس خیلی کم بود. تمام توالی های مربوط به درماسنتور مارژیناتوس در یک شاخه قرار گرفتند توالی مربوط به کنه هیالوما درومداری شباهت زیادی به هیالوما آناتولیکوم آناتولیکوم داشت و توالی مربوط به رپی سفالوس بورسا فقط در تعداد 16 جفت باز ثابت با توالی رپی سفالوس تورانیکوس تفاوت داشت. نتایج بدست آمده مزایای استفاده تجزیه و تحلیل توالی های بدست آمده از ITS2-rDNA را در فیلوژنی کنه های سخت نشان می دهد. برنامه های اضافی برای جمع آوری کنه های بیشتر از نقاط مختلف ایران و افزایش اطلاعات در این زمینه در آینده در دست بررسی و اجراست. 20- واژه های کلیدی: سیستماتیک مولکولی کنه ها ایکسودیده ITS2 تعیین توالیکلیدواژه ها
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.