ایجاد بانک ژن ماهیان خلیج فارس و دریای عمان

نوع محتوی: طرح پژوهشی
زبان: فارسی
استان موضوع گزارش: تهران
شهر موضوع گزارش: تهران
شناسه ملی سند علمی: R-1051916
تاریخ درج در سایت: 27 بهمن 1397
دسته بندی علمی: علوم کشاورزی
مشاهده: 343
تعداد صفحات: 78
سال انتشار: 1394

نسخه کامل طرح پژوهشی منتشر نشده است و در دسترس نیست.

  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این طرح پژوهشی:

چکیده طرح پژوهشی:

مطالعات ژنتیک و ایجاد بانک ژن می تواند رهنمودهایی برای بهبود تنوع و شناسایی ساختار جمعیت ، صید قاچاق ، تشخیص میزان هم خونی و طبقه بندی ژنتیکی جانوران ارایه نماید . در این تحقیق نمونه برداری از مناطق مهم زیستگاه های گونه های مورد مطالعه مانندپوگزنده با نام علمی Dasyatisbennetti، گربه ماهی بزرگ با نام علمی Netumathalassina ، گربهماهیپوزهگرد با نام علمی Netumabilineata ، کوسهماهیشبهدنداننما با نام علمی Carcharhinusleucas ، زمردماهینواراریب با نام علمی Choerodonrobustus ، گیشپوزهدراز با نام علمی Carangoideschrysophrys ، کفشکپهن چپ رخ با نام علمی Pseudorhombusarsius ، هوور معمولی با نام علمی Thunnus tonggol ، زرده با نام علمی Euthynnusaffinisو در نهایت یال اسبی با نام علمی Trichiuruslepturus انجام گرفت. استخراج DNATotal با استفاده از فنل – کلروفورم انجام گردید. استفاده از روش فنل کلروفرم از متداول ترین روشها در اکثر آزمایشات مولکولی در جهت دستیابی به DNA با وزن مولکولی و کیفیت بالا در تهیه بانک ژن میباشد.پس از توالی یابی با استفاده از نرم افزار BioEdit و ابزار قدرتمند Blast و رویه Blasten در پایگاه NCBI میزان همولوژی توالی های بدست آمده سنجیده شد و و رسم درخت فایلوژنی و میزان فاصله ژنتیکی گونه های مورد نظرانجام گردید.بر اساس نتایج به دست آمده، نسبت جذب طول موج 260 به طول موج 280 نانومتر در نمونه ها بین 8/1– 1/2 قرار داشت که نشانگر کیفیت خوب DNA نمونه ها بود. بهینه سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن 16SrRNA با استفاده از گرادیانت دمایی60- 48 درجه سانتیگراد نشان داد که مناسب-ترین دما برای اتصال آغازگر، دما های58-54درجه سانتیگراد برای نمونه های مختلف محاسبه گردید.این طرح با اهدافی از جمله شناسایی ساختار ژنتیکی گونه ها، و رسم درخت فایلوژنی آنها با استفاده از ژن 16s ، تهیه شناسنامه و ثبت کامپیوتری مشخصات سلولهای ذخیره شده و ساماندهی ساختار و تمرکز مدیریت بر منابع ژنتیکی 10گونه مهم و در معرض تهدید از ماهیان منطقه خلیج فارس از طریق ایجاد یک شبکه منسجم ذخایر ژنتیکی آبزیان این منطقه سعی در شناسایی ذخایر ژنتیکی و ایجاد بانک ژن آبزیان با اهداف ذکر شده دارد.همچنین شناسایی گونه ای از کفشک ماهیان به نام Pseudorhombus pentophthalmus میباشد که به صورت یک هاپلوتایپ جدید با اختلاف ژنتیکی 7 درصدی از دیگر نمونه های ثبت شده در بانک جهانی ژن متمایز شده است از دستاوردهای مهم این تحقیق میباشد.واژههایکلیدی: بانک ژن ماهی ، mtDNA ، ذخایر ژنتیکی،16s rRNA ،خلیج فارس و دریای عمان