بررسی ساختار جمعیت و شناسایی نواحی تحت انتخاب در ژنگان اسب های کرد و عرب ایرانی
- سال انتشار: 1396
- محل انتشار: فصلنامه علوم دامی ایران، دوره: 48، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_IJAS-48-3_012
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 429
نویسندگان
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
دانشیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
چکیده
اسب عرب از قدیمیترین نژادهای اسب جهان است. این نژاد عملکرد بسیار خوبی در مسابقات استقامتی و به طورکلی عملکرد ورزشی داشته و در تشکیل برخی نژادهای مهم جهان نقش داشته است. در مقابل، اسب کرد که بیشتر در زمین های ناهموار و مناطق کوهستانی زندگی میکند، مناسب سواری در مناطق کوهستانی و مسابقات چوگان است. برای بررسی ساختار جمعیت و شناسایی قطعه های کروموزمی تحت انتخاب در این دو جمعیت، از 38 اسب عرب و 58 اسب کرد نمونه خون و مو گرفته شد. نمونهها پس از استخراج DNA، توسط 670K Axiom Equine Genotyping Array تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. تحلیل مولفههای اصلی (PCA) روی داده های به دست آمده از تعیین نژادگان انجام شد؛ سپس آماره Fst برای هر SNP محاسبه و برای جلوگیری از اثر تنوع تصادفی ذاتی Fst محاسبه شده برای تک SNP، آنها در طول هر کروموزوم همگن شدند. نتایج به دست آمده از تحلیل مولفههای اصلی این دو جمعیت نشان داد اسبهای عرب ایرانی نسبت به اسبهای کرد تنوع ژنتیکی بالاتری دارند. در این تحقیق، نشانههای انتخاب در شش جایگاه ژنگانی (ژنومی) شناسایی شد که بالاترین میزان آماره Fst در کروموزم شماره 8 مشاهده شد. حاشیهنویسی جایگاههای تحت انتخاب منجر به شناسایی ژنهایی همانند ژنهای CaMKK2، ATP2A2 و MLXIP شد، که به احتمال با عملکرد در مسابقات استقامتی و به طورکلی عملکرد ورزشی در اسبها مرتبط هستند و برای بررسی های بیشتر پیشنهاد میشوند.کلیدواژه ها
تنوع ژنتیکی, نژاد اسب عرب, نژاد اسب کرد, نشانه های انتخاباطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.