مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن موثر در مقاومت به خشکی LEA) Wdhn13 ) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها

خشکی در واقع یک رویداد هواشناختی است که با عدم وقوع بارندگی در یک دوره زمانی همراه می باشد، دو ره ای که به اندازه کافی بلند است تا باعث تخلیه رطوبت خاک و تنش کمبود آب همراه با کاهش پتانسیل آب در بافتهای گیاهی گردد. تنش خشکی مانع از تظاهر کامل پتانسیل ژنتیکی گیاهان زراعی می شود و از اینرو موجب کاهش تولیدات گیاهی می گردد. با توجه به اینکه خشکی یکی از معضلات کشاورزی امروز است و با توجه به اینکه گندم یکی از مهمترین محصولات زراعی است و بخش مهمی از زنجیره غذایی انسان را به خود اختصاص داده و همچنین اینکه سطح زیر کشت آن در کشور ما بالاست و کشور ما نیز در کمربند خشک و نیمه خشک قرار دارد، لذا مطالعات در زمینه مقاومت به خشکی حائز اهمیت است. با توجه به اینکه توالی ژن Wdhn13 که یکی از ژن های مقاومت به خشکی بوده و باعث سنتز پروتئین LEA در گندم می شود تنها در گندم نان ( T. aestivum ) توالی یابی شده لزوم مطالعه و انجام این طرح جهت بدست آوردن آلل های جدیدی از این ژن در گونه های زراعی و وحشی گندم از جمله گندم های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید جهت شناسایی و توالی یابی و انتقال به گونه های حساس حائز اهمیت است. در این تحقیق از گندم های زراعی نان گنبد، سرداری، دروم شوش، دروم گنبد و گندم های وحشی اورارتو، دیکوکوئیدز، تائوشی و اسپلتوئیدز استفاده شد، که پس از PCR توسط پرایمر تخصصی طراحی شده از روی توالی موجود در NCBI قطعه مورد نظر در نمونه های سرداری، نان شوش، دوروم بروجرد، دوروم گنبد، اورارتو و دیکوکوئیدزتکثیر شد. پس از مطالعه بیوانفورماتیکی توالی ژن Wdhn13 در گندم های دارای ژن مورد نظر مشخص شد که توالی این ژن در گندم سرداری با توالی موجود در NCBI بیشترین شباهت و توالی ژن در گندم اورارتو کمترین شباهت را با توالی موجود در NCBI دارد. همردیفی از طریق نرم افزار BLAST و درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس الگوریتم UPGMA نیز موید این نتیجه بودند، جدول فاصله توالی ها نیز موید این بود که نتایج BLAST و درخت فیلوژنت کی بر هم منطبق می باشند.

کلیدواژه ها:

ژن Wdhn13 ، پروتئین LEA ، گندم ، مقاومت به خشکی