ردیابی ژن اندوگلوکاناز و مقایسه خصوصیات پروتئینی آن در چند جدایه قارچ دارای فعالیت بالای سلولازی

سلولز مهمترین پلی ساکارید دیواره سلولی و یکی از فراوانترین هیدروکربن های موجود در طبیعت است و در حدود 40% از توده زنده گیاهی را تشکیل می دهد. سلولز فاقد حلالیت در آب است و نمی تواند وارد سلول شود، بنابرین آنزیم های سلولاز باید در محیط ترشح شده یا بصورت متصل به سطح خارجی میکروارگانیزم های سلولوتیک قرار گیرند. همچنین قارچ ها یکی از میکروارگانیسم های مهم در تولید آنزیم سلولاز محسوب می شوند، در این تحقیق گونه های قارچی جمع آوری شده از شمال کشور، در محیط کربوکسی متیل سلولز (CMC) و با معرف آرسنات مولیبدات توسط اسپکتوفتومتر مورد ارزیابی فعالیت سلولازی قرار گرفتند. 4 ایزوله برتر Trichoderma longibrachiatum ,Trichoderma viride ,Aspergillus terreus و Penicillium oxalicum بر اساس سوبسترا مورد استفاده برای ردیابی و توالی یابی ژن بتا1و4 اندوگلوکاناز، استفاده شدند. استخراج RNA انجام و cDNA ساخته و ژن مورد نظر تکثیر گردید، سپس ژن های تکثیر شده توالی یابی و آنالیز های بیوانفورماتیکی بر روی توالی ژن و ترجمهء اسیدآمینه آنها انجام شد. توالی ها دارای همولوژی بالا با توالی همین ژن در گونه مورد نظر خودشان در بانک اطلاعاتی NCBI بودند. همچنین وزن ملکولی پروتئین حاصل و نقطه ایزوالکتریک آن در توالی های مورد مطالعه تخمین زده شد .بر اساس نتایج، محیط CMC قادر به القاء بیان این ژن و قطعه توالی یابی شده مربوط به ژن بتا 1و4 اندوگلوکاناز یاEG1 می باشند

کلیدواژه ها:

ژن اندوگلوکاناز ، قارچ ، فعالیت سلولازی ، همولوژی