استفاده از الگوریتم کامبت با رابط موازی سازی Open Mp برای مطابقت در رشته های DNA

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 776

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

EMAA01_136

تاریخ نمایه سازی: 19 تیر 1394

چکیده مقاله:

در این مقاله سعی دارد تا با استفاده از الگوریتم موازی در سطح DNA پروتئین برای مطابقت در رشته های DNA را مورد بررسیقرار دهد، و یک الگوریتم جدید به نام کامبت 1 که زاتا یک الگوریتم سریال است را به نحوه ی که در ادامه به شرح آن می پردازد، کهقسمتی از الگوریتم را به صورت موازی با رابط موازی سازی Open Mp پیاده سازی کند. تا با استفاده از آن بتواند مطابقت رشتههای DNA در سطح DNA پروتئین از لحاظ Speed-up نسبت به الگوریتم های دیگری، که به حالت ایده آل نزدیک تر باشد را ارائهکند و مقایسه الگوریتم مذکور را با تعداد پردازنده های متفاوت را مورد بررسی قرار دهد.

نویسندگان

میلاد قاسمزاده

دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه کامپیوتر، دانشگاه بین المللی امام رضا (ع)، مشهد

نجمه فیل اللهی

دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه کامپیوتر، دانشگاه بین المللی امام رضا (ع)، مشهد

عبدالرضا سوادی

استادیار، دانشکده مهندسی، دانشگاه فردوسی، مشهد

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • B. Parhami, Introduction to Parallel Processing: Algorithms and Architectu res, ...
  • _ Levin, David. "DNA Computing". IEEE Computing in Engineering , ...
  • "DNA Chips", Technology Review , January- february _ 200, pp. ...
  • _ N. C. Jones and P. A. Pevzner, An introduction ...
  • J. Hein, R. Lyngso, and C. Pedersen, Comparision of coding ...
  • Programming 193)(1988), 259- 275. ...
  • X. Huang, A Space- Efficient Parallel Sequence Algorithm ...
  • Multiprocessor, Interational Journal of Parallel Programming 18(3(1989), 223- 239. ...
  • S. Aluru and , Rajko, Space and Time Optimal Parallel ...
  • /) 0] Where did the BLOSUM62 alignment SCOe matrix come ...
  • نمایش کامل مراجع